Il corso si propone di fornire agli studenti nozioni su diverse tecnologie biologiche quali PCR quantitativa, DNA microarray, protein microarray, microRNA microarray, comparative genomic hybridization (CGH), Chromatin Immunoprecipitation (ChIP)-on-Chip, Next-generation sequencing. Saranno acquisiti inoltre elementi di bioinformatica per l'analisi dei genomi e per la ricerca di informazioni biologiche su banche dati.

Tecniche di amplificazione del DNA (tecniche basate sulla PCR; NASBA; SDA; LAMP; Whole Genome Amplification; Whole Transcriptome Amplification)

Real-time PCR: metodiche, utilizzo e analisi dei dati. Analisi High Resolution Melt (HRM)

DNA Microarrays: tipologie e utilizzo nello studio del trascrittoma. Utilizzo di software per l'analisi dei dati. Rilevazione di microrganismi tramite DNA microarrays.

SNPs genotyping

Metodi per identificare interazioni proteina-proteina su scala genomica (double hybrid system; Protein arrays).

RNA interference. Tecniche per lo studio dei microRNA

Chip-on-chip e analisi di metilazione del DNA

Ibridazione Genomica comparativa (CGH) su array

Next-generation sequencing

La metagenomica come strumento per lo studio delle comunità microbiche

Utilizzo dei principali tools per l'analisi delle sequenze e la ricerca di informazioni biologiche su banche dati (BLAST, PubMed, nucleotide database)

Analisi bioinformatica dei dati di microarray in studi di espressione genica e per la rilevazione di microrganismi. Ricerca di informazioni biologiche in banche dati online.

Modalità didattiche

Lezione frontale 

Obblighi

Nessuno

Modalità di
accertamento

prova scritta propedeutica all'orale

Modalità didattiche

Il materiale fornito durante le lezioni sarà scaricabile dal sito della biblioteca.

Modalità di
accertamento

prova scritta propedeutica all'orale