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BIOINFORMATICA

A.A. CFU
2006/2007 8
Docente Email Ricevimento studenti
Alessandro Bogliolo

Assegnato al Corso di Studio

Giorno Orario Aula

Programma

01. Introduzione 01.01 Confronto tra sistemi di calcolo e sistemi biologici 01.02 Biologia computazionale 01.03 Sistemi di elaborazione ispirati alla biologia 01.04 Esempi 02. Basi teoriche 02.01 Teoria dell'informazione 02.02 Teoria della probabilit? 02.03 Algoritmi 03. Allineamento di sequenze 03.01 Formulazione del problema 03.02 Verosimiglianza e punteggi 03.03 Caratterizzazione delle matrici di sostituzione 03.04 Distanza di edit e similarit? 03.05 Programmazione dinamica 03.06 Algoritmi di allineamento esatti 03.07 Algoritmi di allineamento euristici 04. Allineamento multiplo 04.01 Formulazione del problema 04.02 Significato strutturale 04.03 Significato filogenetico 04.04 Algoritmi 05. Sequenziamento di biomolecole 05.01 Formulazione del problema 05.02 Sequenziamento di frammenti 05.03 Decodifica di elettroferogrammi 05.04 Qualit? delle basi 05.05 Sequenziamento del genoma 05.06 Assemblaggio di frammenti 06. Progetto di primer 06.01 Formulazione del problema 06.02 Primer per sequenziamento 06.03 Primer per PCR 07. Analisi di microarray 07.01 Struttura di un microarray 07.02 Acquisizione dati 07.03 Elaborazione delle immagini 07.04 Analisi dei dati: scatterplot, classificazione, clustering 08. Laboratorio 08.01 Introduzione all'uso di strumenti bioinformatici 08.02 Uso di BioEdit per l'allineamento di sequenze 08.03 Uso di Oligo per il progetto di primer 08.04 Uso di GenePix per l'analisi di microarray

Modalità Didattiche, Obblighi, Testi di Studio e Modalità di Accertamento

Modalità didattiche
Lezione frontale
Modalità di
accertamento
Esame orale
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